MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 7695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017563	T	7	7	75	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017563	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017563	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017563	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017563	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017563	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017563	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017563	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017563	A	6	6	4417	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017563	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017563	TA	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017563	CTTTT	2	10	8597	8606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017563	A	8	8	8686	8693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017563	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017563	GGAAA	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017563	GAT	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017563	TAA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017563	AAT	2	6	12696	12701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017563	ATA	3	9	12706	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017563	CTT	2	6	12716	12721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017563	TGA	2	6	14693	14698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017563	TGA	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017563	TGA	2	6	15640	15645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017563	TGG	2	6	15657	15662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017563	T	6	6	15698	15703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017563	GCG	2	6	15724	15729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017563	GAT	2	6	15862	15867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017563	AAT	2	6	15891	15896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017563	ATG	2	6	15905	15910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017563	TTCT	2	8	15964	15971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017563	ATG	2	6	15973	15978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017563	A	7	7	16027	16033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017563	AGC	2	6	16909	16914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017563	ATTA	2	8	17411	17418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017563	T	6	6	17424	17429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017563	CAGT	2	8	17431	17438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017563	T	6	6	17455	17460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017563	TAA	2	6	17493	17498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017563	A	6	6	17500	17505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017563	TTA	2	6	17506	17511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017563	A	6	6	17511	17516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017563	A	6	6	17531	17536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017563	AAG	2	6	17552	17557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017563	GAT	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017563	GA	3	6	17586	17591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017563	GAA	2	6	17602	17607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017563	A	7	7	17611	17617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017563	A	7	7	17622	17628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017563	AG	3	6	17676	17681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017563	AGA	2	6	17730	17735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017563	GAC	2	6	17771	17776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017563	ATT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017563	GGC	2	6	17848	17853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017563	AG	3	6	17883	17888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017563	CTT	2	6	17898	17903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017563	ATTT	2	8	18010	18017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017563	TAG	2	6	18065	18070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017563	CGA	2	6	18093	18098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017563	GCA	2	6	18167	18172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017563	CGC	2	6	18214	18219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017563	GTGA	2	8	18220	18227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017563	TGT	2	6	18253	18258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017563	CAG	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017563	AGCG	2	8	18391	18398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017563	AT	3	6	18520	18525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017563	GGA	2	6	18526	18531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017563	CT	3	6	18551	18556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017563	GAA	2	6	18790	18795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017563	GGT	2	6	18864	18869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017563	GTC	2	6	18878	18883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017563	TCGTG	2	10	18887	18896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017563	CAT	2	6	18946	18951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017563	TAA	2	6	18981	18986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017563	GGA	2	6	18990	18995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017563	ATC	2	6	19014	19019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017563	AC	3	6	19041	19046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017563	TGGT	2	8	19056	19063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017563	CGC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017563	AC	3	6	19210	19215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017563	CAC	2	6	19225	19230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017563	AGCC	2	8	19272	19279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017563	GAT	2	6	19295	19300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017563	CCT	2	6	19351	19356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017563	AGG	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017563	GTAA	2	8	19547	19554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017563	ATAG	2	8	19561	19568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017563	GTTAA	2	10	19633	19642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017563	ACG	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017563	TAG	2	6	19867	19872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017563	GCGA	2	8	19875	19882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017563	AGA	2	6	19954	19959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017563	AG	3	6	19982	19987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017563	TCG	2	6	20057	20062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017563	GGA	2	6	20070	20075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017563	CT	3	6	20096	20101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017563	GGGAG	2	10	20151	20160	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017563	ACA	2	6	20188	20193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017563	ATG	2	6	20255	20260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017563	GGA	2	6	20388	20393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017563	TC	3	6	20474	20479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017563	ACC	2	6	20653	20658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017563	AT	3	6	20674	20679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017563	AGC	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017563	ATTC	2	8	20740	20747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017563	GAA	2	6	20867	20872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017563	GAG	2	6	20883	20888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017563	GA	3	6	21013	21018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017563	ACA	2	6	21039	21044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017563	TA	3	6	21067	21072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017563	CTAA	2	8	21094	21101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017563	TAG	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017563	GA	3	6	21308	21313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017563	CTGA	2	8	21367	21374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017563	CT	3	6	21424	21429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017563	GAT	2	6	21442	21447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017563	CGG	2	6	21533	21538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017563	GA	3	6	21631	21636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017563	TAGG	2	8	21749	21756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017563	GTT	2	6	21793	21798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017563	TAC	2	6	21803	21808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017563	CCT	2	6	21891	21896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017563	GGT	2	6	22027	22032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017563	TCG	2	6	22142	22147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017563	CGT	2	6	22222	22227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017563	GTT	2	6	22325	22330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017563	AGGGA	2	10	22360	22369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017563	GA	3	6	22446	22451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017563	GAAGTG	2	12	22471	22482	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017563	ACTAAT	2	12	22501	22512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017563	AT	3	6	22546	22551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017563	TTGAG	2	10	22594	22603	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017563	GTG	2	6	22817	22822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017563	AT	3	6	22975	22980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017563	A	6	6	23067	23072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017563	ACC	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017563	CGT	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017563	GAG	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017563	TAA	3	9	23325	23333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017563	CTC	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017563	CGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017563	TA	3	6	23566	23571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017563	AT	3	6	23655	23660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017563	GGA	2	6	23675	23680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017563	GCGT	2	8	23734	23741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017563	TCC	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017563	AGC	2	6	23784	23789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017563	TCG	2	6	23798	23803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017563	CGG	2	6	23898	23903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017563	TGT	2	6	23927	23932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017563	TGT	2	6	23975	23980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017563	GGT	2	6	24089	24094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017563	TAT	2	6	24206	24211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017563	T	6	6	24313	24318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017563	TCT	2	6	24370	24375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_017563	AAT	2	6	27259	27264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017563	A	6	6	27356	27361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017563	TAG	2	6	27375	27380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017563	TAA	2	6	28724	28729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017563	A	6	6	56877	56882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017563	GATA	2	8	56896	56903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_017563	T	7	7	56968	56974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017563	A	6	6	56985	56990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017563	AAT	2	6	57039	57044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017563	ATG	2	6	57101	57106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017563	CGT	2	6	57116	57121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017563	T	6	6	57167	57172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017563	GTT	2	6	77135	77140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017563	AGGGA	2	10	77170	77179	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017563	GA	3	6	77256	77261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017563	GAAGTG	2	12	77281	77292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017563	ACTAAT	2	12	77311	77322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
443	NC_017563	AT	3	6	77356	77361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_017563	CGG	2	6	77844	77849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_017563	TCC	2	6	77970	77975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_017563	TCG	2	6	78010	78015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_017563	CGG	2	6	78175	78180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_017563	T	6	6	78606	78611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017563	TA	3	6	84728	84733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_017563	A	6	6	85203	85208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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